所以关于转基因产品的危害性都是出于猜测阶段，没有事实可以证实。而人们对食用转基因大豆油的担忧在于是否有些微量混杂在油脂中，进而被人摄入，从而影响人的安全，它的危害可能体现在以下几个方面：
1、 所转基因可能会有人类所不知的功能，与植物合成一些对人类健康有害的物质，并随大豆油进入人体造成影响。
2、 大豆可能会被施以过多的草甘膦除草剂，这些除草剂可能随大豆油进入人体，影响人体的健康。
3、 影响人类的基因。转基因大豆中所转的基因片断混入人体，从而对人体本身的基因造成影响。
4、 转基因大豆的EPSPS合成酶比普通的大豆多，而过多的EPSPS合成酶进入人体，可能会影响人类的健康。
食用油主要成分是甘油三脂，而转基因大豆所转移的基因的作用就是让植物产生更多EPSPS酶，和植物油脂的成分没有关系，而且在加工豆油的过程中转基因成分大部分已经被去掉了，所以不必过分担心食用转基金大豆油对人体的危害。
