新生儿巨细胞包涵体病感染有两个途径，其传染源共同点都是来自妈妈，可分为先天性和后天性，先天性就是通过胎盘将此病毒传给胎儿，而另外一种后天性就是通过产道或母乳感染。无论是先天感染还是后天感染其危害性同样严重。
新生儿感染巨细胞包涵体病10%～12%出生时有症状，表现为巨细胞病毒，具体症状包括：高胆红素血症、肝炎、肝脾肿大、出血点、脑畸形（常见的是脑室周围钙化）、脉络膜视网膜炎。
有症状的患儿当中，40%～58%有远期后遗症，最常见的感音神经性耳聋，占10%～15%。出生时没有症状的新生儿，约13.5%有后遗症，主要是感音神经性耳聋以及认知和神经损害症状。
确诊新生儿患巨细胞包涵体病使用抗病毒药物治疗可能会减少新生儿的损害，但同时出会存在一些副作用可能会引起白细胞计数减少，血小板减少、肝功能异常、脉络膜视网膜炎、细菌感染等。
