1、注意食材的搭配。花椰菜中含有少量导致甲状腺肿大的物质，经常食用者应注意补充碘。如加入碘盐或食用海藻等海味食物。另外，花椰菜不宜与猪肝和黄瓜同食。花椰菜纤维中的醛糖酸基容易与猪肝中的铁、锌等微量元素发生反应，因此两者同食会导致人体对这些元素的吸收大大降低；猪肝中的铜、铁元素还会使花椰菜中的维生素C氧化为脱氢抗坏血酸，失去原来的功效。
2、花椰菜容易生菜虫，在生长的过程中，有些人为了减少菜虫对花椰菜的残害，会喷洒大量的农药，再加上花椰菜表面凹凸不平，更易积蓄农药残留，所以吃花椰菜前应先放盐水中浸泡5分钟，以去除残留农药和菜虫。
3、花椰菜在肠胃中分解后容易引起胀气。不过，如果在烹调花椰菜时加一些大蒜、胡椒、小茴香等辛辣调料，便可以大大减少胀气的不适，还有利于增进食欲，帮助消化。
4、花椰菜不耐烧煮，宜急火快炒，尽量选择短时间加热的方法，断生之后马上盛出，这样才能保持清香脆嫩的口感，使营养素与抗癌成分不致破坏和丢失。而且花椰菜切好之后不能久放，因为在室温空气中放置6小时后，其抗癌成分的损失率可达75%之多。
